Feuille de route

Principes et engagements de SPE3DLab

L’origine du projet SPE3DLab est la création d’un outil permettant aux praticiens de mettre en oeuvre une« médecine de précision ».

Les sources de données se multiplient chaque jour, partout, sous différentes formes ; on parle de « big data », de « smart data ». Ces données sont liées à l’activité humaine, individuelle, collective ou institutionnelle mais informent également sur l’environnement naturel et humain à diverses échelles. Comment utiliser ces mannes d’informations potentielles, comment les interroger le plus pertinemment possible ? Nos sociétés se retrouvent à l’intersection entre science et ingénierie des données : comment peut-on dégager des connaissances scientifiques sur la base de ces données ? Comment peut-on utiliser ces données pour agir et interagir ?

Dans le domaine de la santé, des initiatives visant à fédérer ou agréger des données d’origines variées et de formats divers se multiplient, via des initiatives publiques ou privées, commerciales. Des entrepôts de données se constituent dans les hôpitaux, des plateformes fédératives se construisent à l’international, des instituts publics comme l’INDS en France émergent. La plupart de ces solutions demeurent essentiellement des solutions statiques : les données sont rassemblées et stockées en un lieu unique, et leur traitement ultérieur relève du projet scientifique ou industriel, sans intégration ni rétroaction directe entre la production des données, leur traitement, la décision en découlant, et la production de nouvelles données. La rencontre entre données produites, traitement dynamique, et décision des agents ne s’est pas encore faite et les efforts actuels ne se portent pas dans cette direction.


Nous proposons la solution SPE3DLab, qui est un outil orienté question :

« J’ai une question, et j’aimerais interroger des données d’origines et de formats divers sans avoir à me soucier de leur gestion ou de leur traitement »

« Je travaille dans un service de cardiologie, les données des patients du service sont stockées quelque part et j’ai l’autorisation de les interroger dans un but scientifique ou d’amélioration des soins »

SPE3DLab se connecte sur les données et permet de les exploiter sans pour autant que les données soient extraites de leur lieu de stockage sécurisé ou que l’utilisateur accède à leurs détails directement.

« Est-ce que je peux prédire au mieux le risque de réhospitalisation de mes patients ? »

SPE3DLab va utiliser les données disponibles pour en tirer le meilleur modèle prédictif possible.

Ce modèle me satisfait, je veux le tester au jour le jour ?

SPE3DLab rend disponible le modèle prédictif via une page web. Le modèle peut aussi être très facilement intégré aux logiciels de gestion de dossiers patients, à des applications mobiles dédiée.


SPE3DLab utilise différents moteurs de traitement de données selon les questions posées et les types de sources de données. A terme, selon le type d’utilisateur,SPE3DLab sera interrogeable comme un moteur de recherche, en langage naturel (en français, en anglais…).

Le développement et le fonctionnement deSPE3DLab reposent sur les principes fondamentaux suivants :

– développement open source, documenté

– utilisation de librairies documentées, libres de droit

– utilisation de techniques documentées, ayant fait l’objet de publications scientifiques, de consensus

– les choix de design concernant les traitements de données sont documentés et étayés

– l’ergonomie, l’accessibilité et la confiance en l’outil et les traitements effectués doivent prévaloir sur la recherche de la performance optimale de modèles

– tout traitement effectué par le logiciel depuis l’accès aux données jusque la restitution des résultats doit être transparent, tracé et exportable sous forme de code exécutable si l’utilisateur le désire

Présentation des modules

Analyse descriptive

SPE3DLab réalise une analyse descriptive complète de vos données (min, max, range, SD, moyenne, médiane, comparaison des valeurs manquantes, flowchart d’inclusion) qu’il restitue sous la forme de tableaux et de graphique prêts à être utilisés dans vos parutions.

Tests d’hypothèses

SPE3DLab permet de testez vos différentes hypothèses : différences entre deux groupes (avec ou sans hypothèses de nomalité), tests de distribution, …

Analyse de causalités

Explorez les relations de causalité entre vos variables et représentez les sous la forme d’un diagramme.

Régression

SPE3DLab permet de trouver le meilleur modèle explicatif à votre variable d’intérêt.

Recherche de groupes

Identifiez les groupes à l’aide du module de partitionnement.

Analyse prédictive

SPE3DLab vous permet de prédire la valeur ou la classe d’un nouvel enregistrement,

Analyse sémantique

SPE3DLab vous permet d’extraire les données de vos documents (Word, text, pdf) pour en faire des données structurées exploitables.

Intégration dans vos applications

SPE3DLab vous permet d’enregistrer les modèles prédictifs ou sémantiques que vous avez prototypés et les met à disposition de vos applications.